Istri Ganjar adalah anak dari tokoh Nahdlatul Ulama (NU) Purbalingga yaitu cucu dari Kh. Hisyam Abdul Karim, sosok ulama tersohor pendiri pondok di Purbalingga sekaligus pejuang kemerdekaan.
Pernikahan mereka kemudian dikaruniai anak yaitu Muhammad Zinedine Alam Ganjar yang pernah meraih medali emas dalam ajang kompetisi sains di Korea Selatan pada 2015.
Itulah silsilah keluarga Ganjar Pranowo yang memiliki garis keturunan Sunan Kalijaga.***